Далее, для граждан государств – членов Евразийского экономического союза (ЕАЭС), к которым относится Казахстан, статьёй 97 Договора о ЕАЭС установлен особый порядок трудовой деятельности: они вправе осуществлять трудовую деятельность без получения разрешения на работу или патента. Эта норма имеет приоритет перед общими положениями ст. 13 Закона № 115-ФЗ, требующими наличия разрешения или патента. Применительно к вашим обстоятельствам: поскольку у вас есть официальный трудовой договор с московским работодателем, вы как гражданин Казахстана освобождены от обязанности получать патент. Однако сама по себе эта норма не устанавливает продления срока временного пребывания и не отменяет лимит, установленный ст. 5, если только сам Договор не содержит прямого указания на это. В приведённом тексте ст. 97 таких положений нет.
Работодатели и (или) заказчики работ (услуг) государства-члена вправе привлекать к осуществлению трудовой деятельности трудящихся государств-членов без учета ограничений по защите национального рынка труда. При этом трудящимся государств-членов не требуется получение разрешения на осуществление трудовой деятельности в государстве трудоустройства.
— Договор о Евразийском экономическом союзе от 29.05.2014, ст. 97
В силу части 4 статьи 13 Закона № 115-ФЗ иностранный гражданин имеет право осуществлять трудовую деятельность при наличии разрешения на работу или патента, за исключением отдельных категорий, в том числе постоянно или временно проживающих в России. Вы не относитесь к числу таких исключений по этой статье, но поскольку Договор о ЕАЭС является международным договором, он заменяет требование о разрешении или патенте для граждан Казахстана. Таким образом, трудовой договор сам по себе не даёт вам права на превышение 90-дневного лимита пребывания – он лишь легализует вашу работу при условии законного нахождения в стране.
... иностранный гражданин имеет право осуществлять трудовую деятельность в случае, если он достиг возраста восемнадцати лет, при наличии разрешения на работу или патента. Указанный порядок не распространяется на иностранных граждан: 1) постоянно или временно проживающих в Российской Федерации;
— Федеральный закон от 25.07.2002 № 115-ФЗ «О правовом положении иностранных граждан в Российской Федерации», ст. 13
Относительно исключения из реестра контролируемых лиц: сам по себе факт исключения свидетельствует об отсутствии действующих административных ограничений, связанных с вашим нахождением в реестре (например, запрета на въезд). Однако это не освобождает от обязанности соблюдать срок временного пребывания, установленный ст. 5 Закона № 115-ФЗ. Статья 18.8 КоАП РФ предусматривает ответственность за нарушение правил въезда или режима пребывания, включая уклонение от выезда по истечении срока. Если после возвращения вы превысите суммарные 90 суток в текущем календарном году без законного основания, это может повлечь административное наказание, причём в Москве (Московской области) – по части 3 этой статьи с более строгой санкцией. Поскольку реестр контролируемых лиц был сформирован в связи с предыдущим нарушением, его исключение снимает последствия конкретного административного производства, но не продлевает легальный срок пребывания на будущее.
Статья 18.8 КоАП РФ устанавливает ответственность за нарушение иностранным гражданином правил въезда в РФ либо режима пребывания (проживания) в РФ, включая нарушение правил миграционного учета, передвижения или порядка выбора места пребывания или жительства, а также за уклонение от выезда из РФ по истечении определенного срока пребывания. Часть 1.1 предусматривает штраф с выдворением за уклонение от выезда по истечении срока пребывания. Часть 3 устанавливает повышенную ответственность за те же нарушения, совершенные в Москве или Московской области.
— Кодекс Российской Федерации об административных правонарушениях, ст. 18.8
В представленных нормах отсутствует специальная норма, прямо освобождающая трудящихся государств – членов ЕАЭС от соблюдения 90-дневного лимита при наличии трудового договора. В полном тексте Федерального закона № 115-ФЗ содержится часть 5 статьи 5, предусматривающая продление срока временного пребывания на срок действия трудового договора (но не более чем на один год) для безвизовых иностранцев, заключивших трудовой договор. Однако этой нормы нет в предоставленном контексте, поэтому для окончательного ответа необходимо проверить её наличие в действующей редакции закона. Если она применима, то после заключения трудового договора ваш срок пребывания может быть продлён, и тогда суммарные 90 суток не являются препятствием. Без неё – возвращение в Москву возможно, но вы рискуете превысить лимит и быть привлечённым к ответственности по ст. 18.8 КоАП РФ. Рекомендуется обратиться в территориальный орган МВД для официального продления срока пребывания в связи с трудовой деятельностью.