Основная норма, регулирующая само право на такую компенсацию, — ст. 325 ТК РФ. Она предоставляет работнику организаций, расположенных в районах Крайнего Севера, право на оплату проезда и провоза багажа к месту отпуска и обратно один раз в два года. Это право возникает у работника одновременно с правом на первый ежегодный оплачиваемый отпуск. В рассматриваемой ситуации работник своё право реализовал: он получил льготный отпуск, съездил и вернулся. После возвращения он подал документы — это момент фактической реализации права на компенсацию. То обстоятельство, что работник затем подал заявление об увольнении, не отменяет факта возникновения права на возмещение понесённых расходов — оно возникло ранее и уже было реализовано путём подачи документов. Сама ст. 325 не содержит условия о том, что право на выплату утрачивается в случае увольнения впоследствии.
Лица, работающие в организациях, расположенных в районах Крайнего Севера и приравненных к ним местностях, имеют право на оплату один раз в два года за счет средств работодателя стоимости проезда и провоза багажа в пределах территории Российской Федерации к месту использования отпуска и обратно. Право на компенсацию указанных расходов возникает у работника одновременно с правом на получение ежегодного оплачиваемого отпуска за первый год работы в данной организации.
— Трудовой кодекс Российской Федерации, ст. 325
Поскольку рассматриваемая организация является крупной нефтяной компанией (дочернее общество «Роснефти»), а не федеральным государственным органом или учреждением, ст. 326 ТК РФ, регулирующая компенсации при переезде в связи с увольнением для бюджетников, к данному случаю не применяется. Отношения сторон регулируются ст. 325 ТК РФ и коллективным договором, на который ссылается работник. Возможность установления дополнительных гарантий и компенсаций коллективным договором прямо предусмотрена ст. 313 ТК РФ, и в вашем случае коллективный договор, по словам работника, содержит положение о праве на компенсацию. Если коллективным договором не предусмотрено специальных условий, связывающих выплату с обязательной последующей отработкой (например, условие о возврате денег при увольнении в течение определённого срока), то оснований для отказа нет.
Государственные гарантии и компенсации лицам, работающим в районах Крайнего Севера и приравненных к ним местностях, устанавливаются настоящим Кодексом, другими федеральными законами и иными нормативными правовыми актами Российской Федерации. Дополнительные гарантии и компенсации указанным лицам могут устанавливаться законами и иными нормативными правовыми актами субъектов Российской Федерации, нормативными правовыми актами органов местного самоуправления, коллективными договорами, соглашениями, локальными нормативными актами исходя из финансовых возможностей соответствующих субъектов Российской Федерации, органов местного самоуправления и работодателей.
— Трудовой кодекс Российской Федерации, ст. 313
Наконец, ст. 140 ТК РФ устанавливает, что при прекращении трудового договора все суммы, причитающиеся работнику, выплачиваются в день увольнения. Поскольку документы на компенсацию были поданы до увольнения, сумма компенсации уже стала «причитающейся работнику» на момент подачи заявления увольнении, если работодатель успел её признать. Если же на день увольнения выплата ещё не произведена, но документы приняты и подтверждены, эта сумма относится к причитающимся, и работодатель обязан включить её в окончательный расчёт. В случае спора о размере — выплатить неоспариваемую часть. Увольнение по собственному желанию не является основанием для освобождения работодателя от этого обязательства, если право на компенсацию уже возникло.
При прекращении трудового договора выплата всех сумм, причитающихся работнику от работодателя, производится в день увольнения работника. Если работник в день увольнения не работал, то соответствующие суммы должны быть выплачены не позднее следующего дня после предъявления уволенным работником требования о расчете. В случае спора о размерах сумм, причитающихся работнику при увольнении, работодатель обязан в указанный в настоящей статье срок выплатить не оспариваемую им сумму.
— Трудовой кодекс Российской Федерации, ст. 140