"Статья 145.1. Невыплата заработной платы, пенсий, стипендий, пособий и иных выплат (в ред. Федерального закона от 23.12.2010 N 382-ФЗ) (см. текст в предыдущей редакции ) 1. Частичная невыплата свыше трех месяцев заработной платы, пенсий, стипендий, пособий и иных установленных законом выплат, совершенная из корыстной или иной личной заинтересованности руководителем организации, работодателем - физическим лицом, руководителем филиала, представительства или иного обособленного структурного подразделения организации, - наказывается штрафом в размере до ста двадцати тысяч рублей или в размере заработной платы или иного дохода осужденного за период до одного года, либо лишением права занимать определенные должности или заниматься определенной деятельностью на срок до одного года, либо принудите"
— Уголовный кодекс Российской Федерации, ст. 145.1
Таким образом, привлечение по ст. 145.1 УК РФ возможно лишь в случае, если задержка выплаты заработной платы длилась более трёх месяцев (а не «более двух», как указано в вопросе). Необходимо установить точный период невыплаты.
Дополнительно следует оценить возможность квалификации по статье 315 УК РФ (неисполнение судебного акта). Если удержание алиментов и оплаты ЖКХ производилось на основании вступившего в законную силу решения суда (судебного приказа, исполнительного листа), то неисполнение обязанности по перечислению удержанных средств может образовать состав преступления, предусмотренного ст. 315 УК РФ. Однако обязательным условием является злостность неисполнения, а также предварительное привлечение лица к административной ответственности по части 4 статьи 17.15 КоАП РФ за то же деяние. В представленном контексте нет сведений о том, привлекался ли работодатель к административной ответственности, поэтому применение данной статьи преждевременно. При наличии судебного акта и административной преюдиции ст. 315 УК РФ также может быть инкриминирована:
"Статья 315. Неисполнение приговора суда, решения суда или иного судебного акта (в ред. Федерального закона от 02.10.2018 N 348-ФЗ) (см. текст в предыдущей редакции ) 1. Злостное неисполнение вступивших в законную силу приговора суда, решения суда или иного судебного акта, а равно воспрепятствование их исполнению лицом, подвергнутым административному наказанию за деяние, предусмотренное частью 4 статьи 17.15 Кодекса Российской Федерации об административных правонарушениях, совершенное в отношении того же судебного акта, - наказываются штрафом в размере до пятидесяти тысяч рублей или в размере заработной платы или иного дохода осужденного за период до шести месяцев, либо обязательными работами на срок до двухсот сорока часов, либо исправительными работами на срок до одного года, либо принуди"
— Уголовный кодекс Российской Федерации, ст. 315
Таким образом, исходя из описанных фактов, наиболее явно усматриваются признаки преступления, предусмотренного статьёй 160 УК РФ (присвоение или растрата) в отношении средств, удержанных на алименты и ЖКХ. Квалификация по ч. 3 этой статьи (в крупном размере) обоснована, если общая сумма ущерба превышает 250 000 рублей. Статья 145.1 УК РФ применима только при задержке зарплаты более трёх месяцев, что требует уточнения. Статья 315 УК РФ может быть дополнительно инкриминирована при наличии судебного акта и факта привлечения к административной ответственности.