В ситуации усматриваются два ключевых юридических аспекта: порядок реализации права военнослужащего на отпуск и разграничение юридической силы решения ВВК и приказа командира (начальника).
По существу, произошло следующее: военно-врачебная комиссия (ВВК) своим решением (выпиской из протокола) засвидетельствовала наличие у военнослужащего медицинских оснований для предоставления отпуска по болезни (или иного отпуска, связанного с состоянием здоровья) и установила его срок — с 6 июня по 5 июля. Это решение является обязательным для командира, но само по себе оно ещё не порождает для военнослужащего права начать отпуск. Юридическим фактом, с которого отпуск считается предоставленным и военнослужащий может его реализовать (то есть убыть к месту проведения отпуска и не прибывать на службу), является издание соответствующего приказа командиром воинской части. Именно приказ придаёт решению ВВК силу индивидуального правового акта управления, обязательного для всех, в том числе для самого военнослужащего.
Подача рапорта — это необходимая административная процедура, в ходе которой военнослужащий выражает свою волю на использование отпуска в точном соответствии с решением ВВК. Отказ или задержка в подписании рапорта (и, как следствие, в издании приказа) со стороны командира создают правовую неопределённость. Формально до издания приказа отпуск не считается начатым, и у военнослужащего нет законных оснований самостоятельно убыть в отпуск — это может быть расценено как самовольное оставление части или нарушение порядка прохождения военной службы.
Юридически значимым является то, что решение ВВК имеет обязательную силу для командира. Это не рекомендация, а предписание, основанное на состоянии здоровья военнослужащего. Задержка с оформлением приказа без уважительных причин (например, если командир уклоняется от исполнения решения ВВК, не находится на месте, или требует дополнительных документов) затрагивает право военнослужащего на отдых, гарантированное федеральным законом. Кроме того, это может повлиять на исчисление срока самого отпуска: если из-за промедления командира отпуск фактически начнётся позже установленной ВВК даты, то его продолжительность, установленная медицинским решением (30 дней), не может быть сокращена, и окончание отпуска должно сдвинуться. Однако дата начала в приказе должна соответствовать дате, указанной ВВК, либо, если это невозможно, командир обязан обосновать перенос и выпустить приказ задним числом или с соответствующей оговоркой.
Таким образом, в центре конфликта — разрыв между датой, определённой ВВК для начала отпуска (6 июня), и отсутствием на 9 июня приказа командира, который эту дату официально вводит в действие. Военнослужащий находится в положении, когда медицинское предписание уже вступило в силу, но административный механизм его реализации заблокирован бездействием командира.