Непосредственно критерии годности к военной службе для вашей ситуации устанавливает статья 63 расписания болезней (Хирургические болезни и поражения костей, крупных суставов, хрящей). После операции на мениске и крестовидной связке ваше колено может сохранять нестабильность, контрактуру или развить деформирующий артроз — все эти состояния прямо перечислены в данной статье. Применительно к вашим фактам: если после периода восстановления (который, как вы верно отмечаете, будет длительным) сохранится нестабильность коленного сустава, подтверждённая функциональными рентгенограммами, либо стойкая контрактура (ограничение движений), либо деформирующий артроз — ВВК установит категорию годности в зависимости от степени нарушения функции. Пункты «а», «б», «в» этой статьи предусматривают градацию от значительного до умеренного нарушения, причём при значительном нарушении вы можете быть признаны не годным к военной службе (НГ). Ваше указание на хронические проблемы с коленом до травмы усиливает риск того, что послеоперационное состояние подпадёт под пункт «а» или «б», исключающий дальнейшую службу.
Статья 63 расписания болезней (Хирургические болезни и поражения костей, крупных суставов, хрящей) устанавливает категории годности к военной службе при нестабильности крупного сустава, стойкой контрактуре, деформирующем артрозе и других состояниях. Для коленного сустава нестабильность подтверждается функциональными рентгенограммами. Пункты "а", "б", "в" определяют степень нарушения функции и соответствующую категорию годности (НГ - не годен).
— Постановление Правительства РФ от 04.07.2013 № 565 «Об утверждении Положения о военно-врачебной экспертизе», ст. 63
Что касается вашего права на отпуск по болезни, то в предоставленном контексте нормы, регулирующей отпуска военнослужащих (лечебный или очередной), нет. Порядок предоставления отпусков — как очередных, так и по болезни — регламентируется Федеральным законом «О статусе военнослужащих» и Уставом внутренней службы Вооружённых Сил РФ. Вам следует обратить внимание на нормы этих актов, которые устанавливают, что отпуск по болезни предоставляется на основании заключения ВВК о необходимости лечения и реабилитации, а очередной отпуск может быть перенесён на период после выздоровления по вашему желанию или по решению командования. В вашей ситуации — нахождение на больничном всего две недели при ожидаемом длительном восстановлении — именно постановка на учёт в госпитале и прохождение ВВК дадут вам медицинское основание для продления лечения, которое может быть оформлено как отпуск по болезни.