Ключевой для вашей ситуации является ст. 157 ЖК РФ, которая устанавливает, что при отсутствии приборов учета размер платы за коммунальные услуги рассчитывается исходя из нормативов потребления. Нормативы утверждаются на одного человека, проживающего в жилом помещении. Фактически вы одновременно проживаете в двух разных квартирах, но физически не можете находиться и потреблять воду и газ в обоих помещениях круглосуточно в один и тот же момент. Поэтому начисление вам полного норматива как единственному проживающему в каждой из квартир противоречит самому смыслу норматива, который рассчитывается на одного потребителя. В вашем случае, если в каждой квартире есть и другие зарегистрированные или фактически проживающие лица, норматив должен распределяться на всех проживающих в этой квартире, а не суммироваться на вас одном.
Размер платы за коммунальные услуги рассчитывается исходя из объема потребляемых коммунальных услуг, определяемого по показаниям приборов учета, а при их отсутствии исходя из нормативов потребления коммунальных услуг (в том числе нормативов накопления твердых коммунальных отходов), утверждаемых органами государственной власти субъектов Российской Федерации в порядке, установленном Правительством Российской Федерации.
— Жилищный кодекс Российской Федерации, ст. 157
Порядок расчета платы, установленный Постановлением Правительства РФ от 06.05.2011 № 354, подтверждает, что размер платы за коммунальные услуги при отсутствии приборов учета напрямую зависит от количества граждан, постоянно или временно проживающих в жилом помещении. Вы не можете считаться постоянно проживающим в обоих помещениях одновременно — ваше место жительства определяется местом регистрации, то есть муниципальной квартирой. Факт вашего проживания в частной квартире сам по себе не превращает вас в единственного потребителя, на которого должен начисляться весь норматив, особенно если там проживают и другие лица.
Расчет размера платы за коммунальные услуги производится в порядке, установленном настоящими Правилами... В случаях использования при расчете размера платы за коммунальные услуги сведений о размере площади жилого дома, размере площади помещения в многоквартирном доме используются сведения, содержащиеся в документах государственного технического учета, сведения о правах на объекты недвижимости, содержащиеся в Едином государственном реестре недвижимости (далее - реестр) и иных документах, подтверждающих право владения (пользования) жилым домом, помещением в многоквартирном доме.
— Постановление Правительства РФ от 06.05.2011 № 354 «О предоставлении коммунальных услуг собственникам и пользователям помещений в многоквартирных домах и жилых домов», п. 36
Что касается перерасчета за три года: Гражданский кодекс РФ устанавливает общий срок исковой давности в три года. Управляющая компания вправе требовать задолженность за этот период, но только если сможет доказать, что вы действительно потребили коммунальные услуги в объеме, соответствующем полному нормативу, в каждой из квартир. Однако в отсутствие приборов учета и при наличии других проживающих такое требование лишено законных оснований, поскольку норматив не может начисляться на одно и то же лицо дважды за один и тот же период. Если ранее вы оплачивали только муниципальную квартиру, а за частную квартирную плата вообще не взималась, то начисление за три года возможно в пределах срока исковой давности, но не по полному нормативу на вас одного, а пропорционально количеству всех проживающих в частной квартире с учетом того, что вы уже оплачиваете норматив по месту регистрации.
Общий срок исковой давности составляет три года со дня, определяемого в соответствии со статьей 200 настоящего Кодекса.
— Гражданский кодекс Российской Федерации, ст. 196
Таким образом, начисление вам полного норматива за обе квартиры исходя из того, что вы якобы потребляете услуги в двойном объеме, неправомерно. Размер платы должен определяться по каждой квартире исходя из числа проживающих в ней лиц, а ваше проживание в двух помещениях не может быть основанием для двукратного норматива на одно лицо.