Является ли нарушением уменьшение суточных в зарубежной командировке в бюджетной организации по сравнению с постановлением правительства и можно ли требовать разницу?

Обязательны ли суточные по постановлению Правительства для учреждения или учреждение вправе установить меньший размер

Ключевая норма — ст. 168 ТК РФ: она устанавливает обязанность возмещать суточные и разграничивает, кем определяется порядок и размеры возмещения для разных категорий работодателей.

В случае направления в служебную командировку работодатель обязан возмещать работнику: расходы по проезду; расходы по найму жилого помещения; дополнительные расходы, связанные с проживанием вне места постоянного жительства (суточные);
— ст. 168 ТК РФ

Обратите внимание: обязанность работодателя возмещать суточные существует всегда, но размер возмещения для федеральных учреждений определяется нормативными правовыми актами Правительства РФ, а не усмотрением самого учреждения. Значит, бухгалтерия права лишь постольку, поскольку ваш случай относится к последней категории — «другим работодателям» (частные организации), для которых размер действительно определяется локальным актом.

Порядок и размеры возмещения расходов, связанных со служебными командировками, работникам федеральных государственных органов, государственных внебюджетных фондов Российской Федерации, федеральных государственных учреждений определяются нормативными правовыми актами Правительства Российской Федерации. (В редакции федеральных законов от 02.04.2014 № 55-ФЗ, от 30.04.2021 № 109-ФЗ) Порядок и размеры возмещения расходов, связанных со служебными командировками, работникам государственных органов субъектов Российской Федерации, территориальных фондов обязательного медицинского страхования, государственных учреждений субъектов Российской Федерации, органов местного самоуправления, муниципальных учреждений определяются соответственно нормативными правовыми актами органов государственной власти субъектов Российской Федерации, нормативными правовыми актами органов местного самоуправления. (Дополнение частью - Федеральный закон от 02.04.2014 № 55-ФЗ) (В редакции федеральных законов от 03.07.2016 № 347-ФЗ , от 30.04.2021 № 109-ФЗ) Порядок и размеры возмещения расходов, связанных со служебными командировками, работникам других работодателей определяются коллективным договором или локальным нормативным актом, если иное не установлено настоящим Кодексом, другими федеральными законами и иными нормативными правовыми актами Российской Федерации. (Дополнение частью - Федеральный закон от 02.04.2014 № 55-ФЗ) Статья 168 1 .
— абз. 6 ст. 168 ТК РФ

Здесь прямой ответ на ваш спор. Закон различает три уровня регулирования: для федеральных государственных учреждений — акты Правительства РФ; для учреждений субъектов РФ и муниципальных — акты органов власти субъекта РФ/местного самоуправления; для всех остальных работодателей — коллективный договор или локальный акт. «Учреждение само устанавливает размер» — это правило только для третьей категории. Если ваша бюджетная организация является федеральным государственным учреждением, размер суточных за зарубежную командировку задан постановлением Правительства и локальное положение не может быть ниже него.

Если же ваше учреждение региональное или муниципальное, то ориентиром служат не федеральные 2500 руб., а акт субъекта РФ или органа местного самоуправления, и именно его надо смотреть в первую очередь.

Порядок и размеры возмещения расходов, связанных со служебными командировками, работникам государственных органов субъектов Российской Федерации, территориальных фондов обязательного медицинского страхования, государственных учреждений субъектов Российской Федерации, органов местного самоуправления, муниципальных учреждений определяются соответственно нормативными правовыми актами органов государственной власти субъектов Российской Федерации, нормативными правовыми актами органов местного самоуправления.
— абз. 7 ст. 168 ТК РФ

Для федеральных учреждений действует специальное постановление Правительства РФ, устанавливающее суточные при зарубежных командировках в иностранной валюте по приложению к нему.

суточные выплачиваются работникам, заключившим трудовой договор о работе в федеральных государственных органах, работникам государственных внебюджетных фондов Российской Федерации, федеральных государственных учреждений (далее - работники), военнослужащим, проходящим военную службу по контракту в Вооруженных Силах Российской Федерации, федеральных органах исполнительной власти и федеральных государственных органах, в которых федеральным законом предусмотрена военная служба (далее - военнослужащие), при служебных командировках на территории иностранных государств в иностранной валюте в размерах, установленных согласно приложению № 1
— п. 1 Постановления Правительства РФ от 26.12.2005 № 812

Обратите внимание на важную деталь: суточные по этому постановлению выплачиваются в иностранной валюте в размерах по приложению. Если вы называете суммы 1500 и 2500 руб., сопоставляйте именно то, что заложено в приказе и положении вашего учреждения, с нормой приложения для страны командировки (валютный эквивалент/рублёвая выплата). Само постановление адресовано работникам федеральных органов, федеральных учреждений и государственных внебюджетных фондов — это ещё раз подтверждает, что для этой категории его нормы обязательны, а не рекомендательны.

Выплата суточных в иностранной валюте и надбавок в соответствии с пунктом 1 настоящего постановления производится работникам федеральными государственными органами, государственными внебюджетными фондами Российской Федерации, федеральными государственными учреждениями, военнослужащим - федеральными органами исполнительной власти и федеральными государственными органами, в которых федеральным законом предусмотрена военная служба, в пределах средств федерального бюджета и средств соответствующих бюджетов государственных внебюджетных фондов Российской Федерации, выделенных на соответствующий год на их содержание
— п. 11 Постановления Правительства РФ от 26.12.2005 № 812

Суточные по п. 1 выплачиваются в пределах средств федерального бюджета, выделенных учреждению на соответствующий год. Это не отменяет обязанности, а лишь определяет источник финансирования: учреждение обязано планировать и выплачивать суточные по установленным нормам; ссылка на «недостаток лимитов» не превращает норму в рекомендацию.

Наконец, общий принцип иерархии актов: локальный акт должен соответствовать актам Правительства, а не наоборот.

Нормативные правовые акты федеральных органов исполнительной власти, содержащие нормы трудового права, не должны противоречить настоящему Кодексу, иным федеральным законам, указам Президента Российской Федерации и постановлениям Правительства Российской Федерации. Законы субъектов Российской Федерации, содержащие нормы трудового права, не должны противоречить настоящему Кодексу и иным федеральным законам. Нормативные правовые акты органов исполнительной власти субъектов Российской Федерации не должны противоречить настоящему Кодексу, иным федеральным законам, указам Президента Российской Федерации, постановлениям Правительства Российской Федерации и нормативным правовым актам федеральных органов исполнительной власти. Органы местного самоуправления имеют право принимать нормативные правовые акты, содержащие нормы трудового права, в пределах своей компетенции в соответствии с настоящим Кодексом, другими федеральными законами и иными нормативными правовыми актами Российской Федерации, законами и иными нормативными правовыми актами субъектов Российской Федерации. (Статья в редакции Федерального закона от 30.06.2006 № 90-ФЗ)
— ст. 5 ТК РФ

И правило о том, что локальный акт, ухудшающий положение работника, просто не применяется:

Нормы локальных нормативных актов, ухудшающие положение работников по сравнению с установленным трудовым законодательством и иными нормативными правовыми актами, содержащими нормы трудового права, коллективным договором, соглашениями, а также локальные нормативные акты, принятые без соблюдения установленного статьей 372 настоящего Кодекса порядка учета мнения представительного органа работников, не подлежат применению. В таких случаях применяются трудовое законодательство и иные нормативные правовые акты, содержащие нормы трудового права, коллективный договор, соглашения.
— ст. 8 ТК РФ

И аналогичное правило для коллективного договора и трудового договора:

Коллективные договоры, соглашения, трудовые договоры не могут содержать условий, ограничивающих права или снижающих уровень гарантий работников по сравнению с установленными трудовым законодательством и иными нормативными правовыми актами, содержащими нормы трудового права. Если такие условия включены в коллективный договор, соглашение или трудовой договор, то они не подлежат применению.
— ст. 9 ТК РФ

Расклад для вас: если ваше учреждение федеральное, а его положение об командировках (и приказ) предусматривают 1500 руб., тогда как приложение к постановлению Правительства для страны вашей командировки даёт более высокий размер (в вашем понимании — 2500 руб.), то эти положения локального акта не подлежат применению в части, ухудшающей ваше положение, а применяется норма постановления Правительства. Занижение размера суточных относительно обязательной нормы — это нарушение трудового законодательства, а не «право учреждения». Если же учреждение региональное/муниципальное либо относится к «другим работодателям», уменьшение против федерального постановления само по себе нарушения не образует — сверять нужно с актом соответствующего уровня (субъекта РФ, муниципалитета) или с локальным актом, если он не ниже применимой нормы.

Вывод: ответ зависит от бюджетного уровня вашего учреждения. Для федерального государственного учреждения зарубежные суточные устанавливаются постановлением Правительства РФ, и локальное положение/приказ с меньшим размером не применяются — это нарушение. Для учреждения субъекта РФ или муниципального размер определяется соответственно актами субъекта РФ или органа местного самоуправления, а для «иных работодателей» — коллективным договором/локальным актом, и федеральная норма к ним не применяется. Ветвление: если учреждение федеральное — вы вправе требовать доплату до нормы постановления; если региональное/муниципальное — проверять региональный/местный акт; если оно не относится к бюджетной сфере по ст. 168 ТК — требования к размеру нет, кроме трудового договора.

Можно ли требовать разницу и какие денежные последствия она влечёт

Право на возмещение расходов в командировке — это государственная гарантия, а не добрая воля работодателя:

При направлении работника в служебную командировку ему гарантируются сохранение места работы (должности) и среднего заработка, а также возмещение расходов, связанных со служебной командировкой. Направление инвалидов в служебные командировки допускается только с их письменного согласия и при условии, если это не запрещено им по состоянию здоровья в соответствии с медицинским заключением, выданным в порядке, установленном федеральными законами и иными нормативными правовыми актами Российской Федерации. При этом указанные работники должны быть в письменной форме ознакомлены со своим правом отказаться от направления в служебную командировку. (Дополнение частью - Федеральный закон от 19.11.2021 № 372-ФЗ)
— ст. 167 ТК РФ

Отсюда следует: недоплата суточных (в той части, где они установлены обязательной нормой) — это нарушение гарантии возмещения расходов, то есть по сути неполная выплата причитающихся вам сумм. На такие суммы начисляется денежная компенсация за задержку:

При нарушении работодателем установленного срока соответственно выплаты заработной платы, оплаты отпуска, выплат при увольнении и (или) других выплат, причитающихся работнику, работодатель обязан выплатить их с уплатой процентов (денежной компенсации) в размере не ниже одной сто пятидесятой действующей в это время ключевой ставки Центрального банка Российской Федерации от начисленных, но не выплаченных в срок сумм и (или) не начисленных своевременно сумм в случае, если вступившим в законную силу решением суда было признано право работника на получение неначисленных сумм, за каждый день задержки начиная со дня, следующего за днем, в который эти суммы должны были быть выплачены при своевременном их начислении в соответствии с трудовым законодательством и иными нормативными правовыми актами, содержащими нормы трудового права, коллективным договором, соглашением, локальным нормативным актом, трудовым договором, по день фактического расчета включительно. При неполной выплате в установленный срок заработной платы и (или) других выплат, причитающихся работнику, размер процентов (денежной компенсации) исчисляется из фактически не выплаченных в срок сумм. (В редакции Федерального закона от 30.01.2024 № 3-ФЗ) Размер выплачиваемой работнику денежной компенсации может быть повышен коллективным договором, локальным нормативным актом или трудовым договором. Обязанность по выплате указанной денежной компенсации возникает независимо от наличия вины работодателя.
— ч. 1 ст. 236 ТК РФ

Начисление не зависит от вины работодателя — значит, ссылка бухгалтерии на «мы так решили, мы не виноваты» компенсацию не снимает. Компенсация считается со дня, следующего за днём, когда сумма должна была быть выплачена по трудовому законодательству/локальному акту, по день фактического расчёта включительно; при частичной выплате — от невыплаченной части.

Дополнительно вы можете требовать компенсацию морального вреда, если докажете неправомерность действий работодателя:

Моральный вред, причиненный работнику неправомерными действиями или бездействием работодателя, возмещается работнику в денежной форме в размерах, определяемых соглашением сторон трудового договора. В случае возникновения спора факт причинения работнику морального вреда и размеры его возмещения определяются судом независимо от подлежащего возмещению имущественного ущерба.
— ст. 237 ТК РФ

Факт и размер морального вреда определяет суд; требование заявляется вместе с основным. Расчёт: при разнице, например, 1000 руб. в день за N дней командировки недоплата = 1000 × N; на неё — проценты по 1/150 ключевой ставки ЦБ РФ за каждый день задержки. Суммы, установленные обязательной нормой, — не доход сверх лимита, поэтому отдельного налогового «штрафа» для вас они не создают. Если доплата будет произведена, удержаний «задним числом» из причитающихся вам сумм быть не должно.

Вывод: по общему правилу вы вправе требовать разницу между фактически выплаченными суточными и размером, установленным применимой обязательной нормой, а на недоплату — проценты (денежную компенсацию) по ст. 236 ТК РФ независимо от вины работодателя, а также компенсацию морального вреда по ст. 237 ТК РФ. Ветвление: если применяется именно постановление Правительства (федеральное учреждение) — разницу считают от нормы постановления; если применим региональный/муниципальный акт — от его нормы; если размер законно определён локальным актом/трудовым договором — оснований для доплаты нет.

Куда обращаться, в какие сроки и какова ответственность работодателя

Способы защиты и их срок различаются, и это критично для вашей ситуации.

В комиссию по трудовым спорам (КТС, если она создана у вас):

Работник может обратиться в комиссию по трудовым спорам в трехмесячный срок со дня, когда он узнал или должен был узнать о нарушении своего права. В случае пропуска по уважительным причинам установленного срока комиссия по трудовым спорам может его восстановить и разрешить спор по существу.
— ст. 386 ТК РФ

Срок для КТС — три месяца со дня, когда вы узнали о нарушении (то есть со дня выплаты суточных в заниженном размере). КТС выдаёт удостоверение, исполняемое принудительно; но она не может рассматривать спор, если дело уже в суде.

В районный суд за разрешением спора о неполной выплате причитающихся сумм:

За разрешением индивидуального трудового спора о невыплате или неполной выплате заработной платы и других выплат, причитающихся работнику, он имеет право обратиться в суд в течение одного года со дня установленного срока выплаты указанных сумм, в том числе в случае невыплаты или неполной выплаты заработной платы и других выплат, причитающихся работнику при увольнении. (Дополнение частью - Федеральный закон от 03.07.2016 № 272-ФЗ) При наличии спора о компенсации морального вреда, причиненного работнику вследствие нарушения его трудовых прав, требование о такой компенсации может быть заявлено в суд одновременно с требованием о восстановлении нарушенных трудовых прав либо в течение трех месяцев после вступления в законную силу решения суда, которым эти права были восстановлены полностью или частично. (Дополнение частью - Федеральный закон от 05.04.2021 № 74-ФЗ) Работодатель имеет право обратиться в суд по спорам о возмещении работником ущерба, причиненного работодателю, в течение одного года со дня обнаружения причиненного ущерба. (В редакции Федерального закона от 30.06.2006 № 90-ФЗ) При пропуске по уважительным причинам сроков, установленных частями первой, второй, третьей и четвертой настоящей статьи, они могут быть восстановлены судом. (В редакции федеральных законов от 03.07.2016 № 272-ФЗ, от 05.04.2021 № 74-ФЗ)
— ч. 2 ст. 392 ТК РФ

Здесь для вас более выгодный срок — один год со дня установленного срока выплаты, поскольку речь идёт о неполной выплате «других выплат, причитающихся работнику». Именно этот — годичный — срок применяется к требованию о взыскании недоплаченных суточных; трёхмесячный срок применяется к прочим индивидуальным трудовым спорам. Иск подаётся в районный суд (спор о взыскании выплат, не связанных с увольнением); работник освобождён от госпошлины. Моральный вред можно заявить одновременно с основным требованием.

Параллельно — жалоба в государственную инспекцию труда (ГИТ) и/или прокуратуру: это способы защиты через надзорный орган:

Каждый имеет право защищать свои трудовые права и свободы всеми способами, не запрещенными законом. Основными способами защиты трудовых прав и свобод являются: самозащита работниками трудовых прав; защита трудовых прав и законных интересов работников профессиональными союзами; федеральный государственный контроль (надзор) за соблюдением трудового законодательства и иных нормативных правовых актов, содержащих нормы трудового права; (В редакции федеральных законов от 18.07.2011 № 242-ФЗ, от 28.06.2021 № 220-ФЗ) судебная защита. (Статья в редакции Федерального закона от 30.06.2006 № 90-ФЗ) Глава 57. ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ КОНТРОЛЬ (НАДЗОР) И ВЕДОМСТВЕННЫЙ КОНТРОЛЬ ЗА СОБЛЮДЕНИЕМ ТРУДОВОГО ЗАКОНОДАТЕЛЬСТВА И ИНЫХ НОРМАТИВНЫХ ПРАВОВЫХ АКТОВ, СОДЕРЖАЩИХ НОРМЫ ТРУДОВОГО ПРАВА (Наименование в редакции федеральных законов от 18.07.2011 № 242-ФЗ, от 28.06.2021 № 220-ФЗ)
— 352

ГИТ и прокуратура рассматривают обращения о нарушениях трудовых прав; ГИТ выдаёт предписание об устранении нарушения и о восстановлении нарушенных прав и может привлечь виновных к ответственности. Само по себе обращение в ГИТ не заменяет суд для взыскания разницы, но эффективно для фиксации нарушения и понуждения учреждения к перерасчёту.

Ответственность за неполную выплату:

Невыплата или неполная выплата в установленный срок заработной платы, других выплат, осуществляемых в рамках трудовых отношений, если эти действия не содержат уголовно наказуемого деяния, либо воспрепятствование работодателем осуществлению работником права на замену кредитной организации, в которую должна быть переведена заработная плата, либо установление заработной платы в размере менее размера, предусмотренного трудовым законодательством, - (В редакции Федерального закона от 26.07.2019 № 221-ФЗ ) влечет предупреждение или наложение административного штрафа на должностных лиц в размере от десяти тысяч до двадцати тысяч рублей; на лиц, осуществляющих предпринимательскую деятельность без образования юридического лица, - от одной тысячи до пяти тысяч рублей; на юридических лиц - от тридцати тысяч до пятидесяти тысяч рублей.
— ч. 6 ст. 5.27 КоАП РФ

Неполная выплата «других выплат в рамках трудовых отношений» (а суточные в обязательной части — именно такая выплата) образует состав административного правонарушения: предупреждение или штраф на должностных лиц 10–20 тыс. руб., на юридических лиц 30–50 тыс. руб. При повторности:

Совершение административного правонарушения, предусмотренного частью 6 настоящей статьи, лицом, ранее подвергнутым административному наказанию за аналогичное правонарушение, если эти действия не содержат уголовно наказуемого деяния, - влечет наложение административного штрафа на должностных лиц в размере от двадцати тысяч до тридцати тысяч рублей или дисквалификацию на срок от одного года до трех лет; на лиц, осуществляющих предпринимательскую деятельность без образования юридического лица, - от десяти тысяч до тридцати тысяч рублей; на юридических лиц - от пятидесяти тысяч до ста тысяч рублей. (Статья в редакции Федерального закона от 03.07.2016 № 272-ФЗ ) Статья 5.27 1 . Нарушение государственных нормативных требований охраны труда, содержащихся в федеральных законах и иных нормативных правовых актах Российской Федерации 1. Нарушение государственных нормативных требований охраны труда, содержащихся в федеральных законах и иных нормативных правовых актах Российской Федерации, за исключением случаев, предусмотренных частями 2 - 4 настоящей статьи и частью 3 статьи 11.23 настоящего Кодекса , - (В редакции Федерального закона от 26.07.2019 № 216-ФЗ ) влечет предупреждение или наложение административного штрафа на должностных лиц в размере от двух тысяч до пяти тысяч рублей; на лиц, осуществляющих предпринимательскую деятельность без образования юридического лица, - от двух тысяч до пяти тысяч рублей; на юридических лиц - от пятидесяти тысяч до восьмидесяти тысяч рублей. 2.
— ч. 7 ст. 5.27 КоАП РФ

А за нарушение самой обязанности возмещать расходы по обязательным нормам (если квалифицировать как нарушение трудового законодательства в целом) применяется общая норма:

Нарушение трудового законодательства и иных нормативных правовых актов, содержащих нормы трудового права, если иное не предусмотрено частями 3, 4 и 6 настоящей статьи и статьей 5.27 1 настоящего Кодекса, - влечет предупреждение или наложение административного штрафа на должностных лиц в размере от одной тысячи до пяти тысяч рублей; на лиц, осуществляющих предпринимательскую деятельность без образования юридического лица, - от одной тысячи до пяти тысяч рублей; на юридических лиц - от тридцати тысяч до пятидесяти тысяч рублей.
— ч. 1 ст. 5.27 КоАП РФ

Организационно: сначала письменно обратитесь в бухгалтерию/руководителю за перерасчётом (заявление с расчётом разницы и ссылкой на постановление и приказ о командировке); при отказе — жалоба в ГИТ (и прокуратуру) и/или иск в районный суд и заявление в КТС, если она есть, — с требованием доплаты, процентов по ст. 236 ТК РФ и морального вреда.

Вывод: защищаться можно через КТС (3 месяца), районный суд (1 год для требований о неполной выплате), ГИТ и прокуратуру. Требовать нужно саму разницу суточных, проценты по ст. 236 ТК РФ (не ниже 1/150 ключевой ставки ЦБ РФ за каждый день задержки) и компенсацию морального вреда; работодателя можно привлечь к административной ответственности по ст. 5.27 КоАП РФ. Подсудность — районный суд, срок по денежному требованию — один год.

Доказательства и порядок исполнения

Доказательства. Для требования разницы вам достаточно подтвердить три вещи: (1) факт командировки — приказ (распоряжение) о направлении в командировку с указанием страны и срока; (2) фактический размер выплаченных суточных — положение об командировках, сам приказ (если в нём прописан размер суточных), расчётный листок или платёжные документы о выплате; (3) применимую норму, с которой сравниваете (постановление Правительства либо акт субъекта РФ/муниципалитета, смотря по уровню учреждения). Соберите эти документы до обращения — они же нужны и для ГИТ, и для суда. Если расчётный листок или приказ не выдавали, запросите письменно у работодателя копии (работодатель обязан их предоставлять по заявлению работника о документах, связанных с работой, в силу ст. 62 ТК РФ).

Исполнение. Решение КТС исполняется через удостоверение, выдаваемое работнику; оно предъявляется приставам и имеет силу исполнительного документа. Решение суда о взыскании разницы, процентов и морального вреда исполняется по исполнительному листу. Предписание ГИТ об устранении нарушения (выплате недоплаченных сумм и восстановлении нарушенных прав) обязательно для работодателя; его неисполнение влечёт административную ответственность, а надзорный орган контролирует устранение. Поэтому параллельные каналы (ГИТ для понуждения и фиксации нарушения, суд/КТС для взыскания денег) усиливают позицию.

Вывод: доказательственная база — приказ о командировке, применимая норма и документы о фактической выплате; исполнение обеспечивается удостоверением КТС, исполнительным листом суда и обязательным предписанием ГИТ под угрозой административной ответственности.

Органы рассмотрения спора и надзор (закрытие вопросов «сроки», «если откажут», «процедура»)

Органы, в которых рассматривается ваш индивидуальный трудовой спор:

Индивидуальные трудовые споры рассматриваются комиссиями по трудовым спорам и судами , если иное не установлено настоящим Кодексом . (В редакции Федерального закона от 31.07.2020 № 246-ФЗ)
— ст. 382 ТК РФ

То есть у вас два судебно-подобных канала: комиссия по трудовым спорам (если она создана у работодателя) и суд. Сроки и особенности каждого уже раскрыты выше: КТС — три месяца со дня, когда узнали о нарушении (ст. 386 ТК РФ); суд по требованию о неполной выплате причитающихся сумм — один год (ч. 2 ст. 392 ТК РФ). Органы надзора — дополнительный канал воздействия, а не подмена суда:

Федеральный государственный контроль (надзор) за соблюдением трудового законодательства и иных нормативных правовых актов, содержащих нормы трудового права, осуществляется федеральной инспекцией труда. Предметом федерального государственного контроля (надзора) за соблюдением трудового законодательства и иных нормативных правовых актов, содержащих нормы трудового права, является соблюдение работодателями требований трудового законодательства, включая законодательство о специальной оценке условий труда, иных нормативных правовых актов, содержащих нормы трудового права, обязательств перед работниками по соглашению в части обязанностей работодателя, установленных частями первой, третьей и четвертой настоящего Кодекса, а также соблюдение организациями, проводящими специальную оценку условий труда, обязательных требований, установленных законодательством о специальной оценке условий труда. (В редакции федеральных законов от 08.08.2024 № 268-ФЗ, от 28.12.2024 № 541-ФЗ) Организация и осуществление федерального государственного контроля (надзора) за соблюдением трудового законодательства и иных нормативных правовых актов, содержащих нормы трудового права, регулируются законодательством Российской Федерации о государственном контроле (надзоре), муниципальном контроле. Положение о федеральном государственном контроле (надзоре) за соблюдением трудового законодательства и иных нормативных правовых актов, содержащих нормы трудового права, утверждается Правительством Российской Федерации.
— ст. 353 ТК РФ

Федеральный государственный надзор за соблюдением трудового законодательства осуществляет именно федеральная инспекция труда (ГИТ), предмет её контроля — соблюдение работодателями требований трудового законодательства. Фактическое занижение суточных относительно обязательной нормы — это несоблюдение требований ст. 168 ТК РФ и акта Правительства, поэтому прямо попадает в предмет контроля ГИТ. При отказе бухгалтерии: подайте заявление в ГИТ о неправомерном занижении суточных — инспекция вправе выдать обязательное предписание об устранении нарушения (выплате разницы) и привлечь виновных к ответственности по ст. 5.27 КоАП РФ. Одновременно (или после) — иск в районный суд о взыскании разницы, процентов и морального вреда; суд и ГИТ — независимые каналы, их можно использовать параллельно.

Условие о том, от какого бюджета финансируется учреждение, определяет не наличие права, а то, каким актом задан обязательный размер суточных (это раскрыто в первом блоке на основании абзацев ст. 168 ТК РФ и постановления № 812): для федерального — Правительство РФ; для субъектового/муниципального — соответствующий акт; для иных — локальный акт/колдоговор.

Вывод: спор рассматривают КТС и районный суд (по денежному требованию — в годичный срок), надзор за правомерностью выплат — федеральная инспекция труда с правом обязательного предписания и привлечения к ответственности; при отказе бухгалтерии идите в ГИТ и/или суд, требуя разницу, проценты и моральный вред.