Даже если предположить, что взыскание само по себе законно (например, если оно предусмотрено специальным законом для вашей категории работников), необходимо проверить условия лишения премии на соответствие статье 135 ТК РФ. Эта норма устанавливает специальные ограничения для снижения премии в связи с дисциплинарным взысканием. Она прямо указывает, что работодатель может снизить размер премии лишь за тот период, в котором было применено взыскание, и такое снижение не может уменьшить вашу месячную заработную плату более чем на 20 процентов. В вашей ситуации взыскание наложено на три месяца, и лишение премии распространено на весь этот срок. Однако согласно ст. 135, снижение премии допустимо только за период начисления, в котором взыскание было применено, то есть за тот месяц (или расчётный период), когда издан приказ. Распространение лишения на два последующих месяца (второй и третий) уже не охватывается этой нормой. Кроме того, даже в месяце применения взыскания работодатель не вправе лишить вас премии в размере, который приведёт к уменьшению вашей общей месячной зарплаты (оклад + премия) более чем на 20 процентов. Если оклад составляет, к примеру, 80% от обычного месячного заработка, а премия — 20%, то полное лишение премии как раз укладывается в 20-процентный лимит. Но если премия больше 20% от обычной зарплаты, то лишение её полностью незаконно — работодатель может снизить премию только до такой величины, чтобы общая сумма зарплаты не уменьшилась более чем на 20% от обычного уровня.
"Статья 135 ТК РФ. Часть третья: 'При установлении систем премирования ... работодатель ... вправе предусмотреть условие о том, что снижение размера премии работнику в связи с применением к нему дисциплинарного взыскания за совершение дисциплинарного проступка осуществляется в отношении только тех входящих в состав заработной платы работника премий, которые начисляются за период, в котором к работнику было применено соответствующее дисциплинарное взыскание, а размер такого снижения премии не может приводить к уменьшению размера месячной заработной платы работника более чем на 20 процентов.'"
— Трудовой кодекс Российской Федерации, ст. 135
Что касается возможности частичной выплаты премии после исправления нарушений в течение срока взыскания, здесь ключевое значение имеет статья 194 ТК РФ, регулирующая снятие дисциплинарного взыскания. Взыскание может быть снято работодателем досрочно — по вашей просьбе, ходатайству руководителя или по собственной инициативе. Если вы исправились и устранили нарушение (сдали отчётность), вы вправе обратиться к работодателю с просьбой о досрочном снятии взыскания. Если работодатель удовлетворит эту просьбу, взыскание будет считаться не имевшим места с даты соответствующего приказа. После этого лишение премии на будущие периоды (оставшуюся часть срока) теряет основание, и премия должна начисляться в обычном порядке. Однако до момента снятия взыскания работодатель вправе продолжать не выплачивать премию, если это предусмотрено локальным актом, но с учётом ограничений ст. 135 по периоду и размеру. Таким образом, ваше право на премию за последующие месяцы не гарантировано автоматически — оно зависит от решения работодателя о досрочном снятии взыскания, которое является его правом, а не обязанностью, если только иное не предусмотрено коллективным договором.
Статья 194. Снятие дисциплинарного взыскания
Если в течение года со дня применения дисциплинарного взыскания работник не будет подвергнут новому дисциплинарному взысканию, то он считается не имеющим дисциплинарного взыскания.
Работодатель до истечения года со дня применения дисциплинарного взыскания имеет право снять его с работника по собственной инициативе, просьбе самого работника, ходатайству его непосредственного руководителя или представительного органа работников.
— Трудовой кодекс Российской Федерации, ст. 194
Наконец, необходимо оценить положение о премировании вашей организации, которое допускает полное лишение премии при дисциплинарных взысканиях. Согласно статье 8 ТК РФ, локальные нормативные акты не могут ухудшать положение работника по сравнению с трудовым законодательством. Если ваше положение о премировании содержит условие о полном лишении премии на весь срок действия взыскания, оно вступает в противоречие с императивными ограничениями статьи 135 ТК РФ (лишение только за период начисления взыскания и не более 20% месячной зарплаты). Такое условие является ничтожным и не подлежит применению. В этой части должны применяться нормы Трудового кодекса напрямую. Следовательно, даже если в локальном акте написано, что премия «может не выплачиваться полностью», это не даёт работодателю права игнорировать законодательные пределы снижения. Возможность частичной выплаты премии по решению начальника не предусмотрена законом в качестве обязанности, но если локальный акт (или приказ) устанавливает, что премия выплачивается по усмотрению работодателя, то при отсутствии дискриминации такое усмотрение допустимо, однако оно не может обходить ограничения ст. 135 по максимальному снижению.
Нормы локальных нормативных актов, ухудшающие положение работников по сравнению с установленным трудовым законодательством и иными нормативными правовыми актами, содержащими нормы трудового права, коллективным договором, соглашениями, а также локальные нормативные акты, принятые без соблюдения установленного статьей 372 настоящего Кодекса порядка учета мнения представительного органа работников, не подлежат применению. В таких случаях применяются трудовое законодательство и иные нормативные правовые акты, содержащие нормы трудового права, коллективный договор, соглашения.
— Трудовой кодекс Российской Федерации, ст. 8
Резюмируя: лишение премии на весь трёхмесячный срок правомерно лишь в той части, которая соответствует норме ст. 135 — то есть за период, в котором взыскание было объявлено (первый месяц), и при условии, что это не уменьшило вашу зарплату более чем на 20%. За два последующих месяца лишение премии незаконно, если только взыскание не было снято досрочно (ст. 194) или в локальном акте не установлен иной, не противоречащий закону порядок. Ваше исправление само по себе не восстанавливает премию автоматически — для этого необходимо досрочное снятие взыскания, которое работодатель может произвести по вашему заявлению. Частичная выплата премии возможна, если работодатель своим решением (не обязательно в виде отдельного приказа, но в рамках действующей системы премирования) определит, что за часть периода вы отработали без нарушений, но это не обязанность, а право работодателя, ограниченное лишь общими принципами недопущения дискриминации и злоупотребления правом.