- Граждане, подлежащие воинскому учету, обязаны: а) состоять на воинском учете по месту жительства или месту пребывания, в том числе не подтвержденным регистрацией по месту жительства и (или) месту пребывания, в военном комиссариате... При этом граждане, не имеющие регистрации по месту жительства и месту пребывания, а также граждане, прибывшие на место пребывания на срок более 3 месяцев и не имеющие регистрации по месту пребывания, для постановки на воинский учет представляют заявление по форме согласно приложению N 3 и сведения по форме, предусмотренной приложением N 2 к настоящему Положению.
— Постановление Правительства РФ от 27.11.2006 № 719 «Об утверждении Положения о воинском учете», п. 50
Согласно статье 10 Федерального закона «О воинской обязанности и военной службе», граждане обязаны состоять на воинском учете в военкомате в соответствии с пунктом 2 статьи 8 этого же закона. Статья 8, в свою очередь, устанавливает общую обязанность граждан состоять на учете, а её пункт 1.2 предусматривает, что постановка на учет может осуществляться без личной явки. Применительно к вашей ситуации: вы явились в военкомат лично, предоставили все документы, однако сотрудники не только не поставили вас на учет, но и не совершили действий по внесению сведений в Реестр воинского учета. Такое бездействие противоречит как обязанности вас учитывать, так и возможности внесения изменений в документы воинского учета без дополнительной явки, которая предусмотрена законом.
Статья 10. Обязанности граждан по воинскому учету 1. В целях обеспечения воинского учета граждане обязаны: состоять на воинском учете в военном комиссариате в соответствии с абзацами первым и третьим пункта 2 статьи 8 настоящего Федерального закона; явиться в указанные в повестке военного комиссариата время и место либо по вызову местной администрации соответствующего поселения, муниципального или городского округа, осуществляющей первичный воинский учет; сообщить в письменной или электронной форме через Портал государственных и муниципальных услуг (функций) в военный комиссариат либо в местную администрацию соответствующего поселения, муниципального или городского округа, осуществляющую первичный воинский учет, об изменении семейного положения, образования, места работы (учебы) или должно
— Федеральный закон от 28.03.1998 № 53-ФЗ «О воинской обязанности и военной службе», ст. 10
Наконец, последствия вашей неявки в военкомат по месту постоянной регистрации в течение двух лет оцениваются отдельно. Сама по себе неявка без уважительной причины по врученной повестке влечёт применение временных мер и может повлечь административную или уголовную ответственность, что прямо указано в Положении. Однако эта норма относится к вашим прошлым действиям по отношению к военкомату в Ростовской области, а не к отказу военкомата Краснодара. Факт вашей неявки не даёт военкомату в Краснодаре права отказать вам в постановке на учёт по месту пребывания — эти правоотношения регулируются разными нормами. Более того, из контекста не следует, что вам была вручена повестка надлежащим образом именно на те даты, которые вы пропустили; в описании указано лишь, что вас «вызывали повесткой» два года назад, но не уточняется, была ли она вручена лично под расписку и с соблюдением всех формальностей. Соответственно, автоматически применять к вам меры ответственности нельзя без установления всех обстоятельств. В любом случае, отказ в постановке на учёт по месту пребывания не может быть обоснован вашим прошлым нарушением по отношению к другому военкомату.
Неявка без уважительной причины по врученной повестке по истечении 20 календарных дней со дня, указанного в повестке, влечет применение временных мер. Уважительные причины: заболевание, тяжелое состояние здоровья близких, непреодолимая сила, иные причины, признанные уважительными. За нарушение обязанностей могут быть применены меры административной и уголовной ответственности.
— Постановление Правительства РФ от 27.11.2006 № 719 «Об утверждении Положения о воинском учете», раздел об обязанностях гражданина
Таким образом, отказ военкомата в Краснодаре закону не соответствует, а требование ехать в Ростовскую область для постановки на учёт является неправомерным, так как вы вправе встать на учёт по месту пребывания. В то же время, ваша неявка в военкомат по месту постоянной регистрации может быть самостоятельным нарушением, за которое возможна ответственность, однако это не препятствует вашей постановке на учёт в Краснодаре при наличии временной регистрации.